臺北地檢署7月6日指揮調查局兵分十路突擊搜查長榮海運總部、巴拿馬商長榮國際及相關高層住所，約談創辦人張榮髮長子張國華、三子張國政及董事柯麗卿等9人，懷疑其於2023年6—8月利用掌握公司擬斥資數百億新臺幣向EIS回購長榮航空等資產的重大未公開利多消息，在禁止交易期內涉嫌內線交易提前買賣股票套利，檢方估算帳面擬制性獲利約21億新臺幣、涉案標的市值增值達150億；7月7日復訊後張國華以1.2億新臺幣（約合人民幣2600餘萬元）天價交保並限制住居出境、張國政1000萬交保，其餘董事分別200萬—500萬交保，全案朝違反《證券交易法》內線交易偵辦，長榮海運聲明配合司法調查且營運財務正常不受影響，建議貨代與外貿企業關注後續公司治理變動及是否影響歐線/美線艙位政策，現階段班輪服務暫未見中斷。