美國衛生與公眾服務部當地時間6月30日致信哈佛大學稱，聯邦工作組調查顯示，哈佛大學未能保護猶太學生，將可能「失去全部聯邦資金支持」。
美國衛生與公眾服務部的民權辦公室當天在給哈佛大學的信中說，調查結果顯示，在某些情況下，哈佛大學「參與」針對猶太學生、教授和工作人員的反猶太活動，哈佛大學存在「非法和不受制止的歧視行為」，哈佛大學的做法違反聯邦民權法。
信中還說，如果哈佛大學不採取有效措施，「將立刻失去全部聯邦資金支持並將繼續影響哈佛大學與聯邦政府的關係」。
哈佛大學當天發表聲明對聯邦政府的調查結果表示強烈反對。聲明說，反猶太主義是「嚴重問題，是不可接受的」，哈佛大學已經採取實質性措施保護該校猶太群體。
美聯社稱，川普政府的調查結果是白宮與哈佛大學爭端的「最新升級」。川普政府此前已經取消哈佛大學約26億美元用於研究的聯邦資金。
5月22日，美國國土安全部宣布，禁止哈佛大學招收國際學生。5月29日，美國麻薩諸塞州聯邦地區法院法官「叫停」該禁令。