隨著兩岸中秋包機日期的逐漸臨近，國航股份重慶分公司從飛機調配、機組人員配備、地面準備等多個方面進行了精心準備，以確保為兩岸同胞提供安全、優質的空中運輸服務。
首先，國航股份重慶分公司要求每個航班都按照專機保障標準配備雙機組，由兩位機長和一名副駕駛、一名國際地區航線報務員組成。在人員配備上，挑選的都是有豐富國際地區航線飛行經驗的飛行員，並且要求其中至少有一位機長和一位副駕駛執行過臺灣包機飛行任務。在航線準備方面，規定機組必須認真研究航線、機場資料，精心考慮飛行過程中的每一個環節，制定特情預案，並開展專項模擬機訓練。此外，針對9、10月南太平洋地區颱風活動頻繁的特點，就可能出現的惡劣天氣，機組制定了備降和臨時申請改變航路預案，選擇了多個合適的備降機場。
其次，為保障好2006年中秋節兩岸包機空中服務工作，國航股份重慶分公司客艙部從人員選拔、證件和資料準備等方面也做好了大量準備工作。為執行好這次包機任務，客艙部選出了6名各有特色的乘務員和兩名經驗豐富的空警隊員。6名乘務員中有5位是乘務長，其中3位是資深乘務檢查員，其中4人都曾經參加過兩岸包機飛行。所選人員服務技能過硬，安全經驗豐富，有很強的組織和溝通協調能力。目前，6名乘務員已經開始了心理準備和相關知識的學習。
再次，國航股份重慶分公司各相關部門也進行了精心準備。據悉，國航承擔此次運輸任務的是國航股份重慶分公司的「北京奧運號」飛機。國航股份重慶分公司籤派提前制訂了運力調配方案，確保該飛機屆時能順利投入包機飛行。分公司地面服務部日前已將機組名單報北京配載，並派出資深教員對機組進行艙單強化培訓。另外，機組人員的證件辦理、服裝和語言規範，以及在臺灣的要求和外出活動紀律等相關培訓工作正在緊張有序地落實中。